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課程簡介

Fiji 與 ImageJ 簡介

  • Fiji 概觀及其在科學研究中的應用
  • 理解 ImageJ 的架構和插件
  • 安裝和設置 Fiji 以實現最佳性能

基礎形象處理技術

  • 形象採集與導入格式
  • 調整對比度、亮度及應用濾鏡
  • 形象堆疊和投影方法

進階形象分析

  • 分割技術:閾值化和邊緣檢測
  • 組織學樣本中的目標計數和粒子分析
  • 測量面積、周長及其他形態學特徵

生物樣本的處理

  • 處理組織學組織、血紅細胞和藻類的形象
  • 顏色去卷积和染色組織的分析
  • 時間序列分析和追蹤細胞運動

自動化與自定義

  • 創建和運行宏以處理重複任務
  • 使用 Fiji 插件進行專業化分析
  • 使用 ImageJ 宏語言 (IJM) 進行基礎腳本編程

數據管理與報告

  • 導出結果並生成報告
  • 標註形象並準備用於發表的數據
  • 可重複形象分析的最佳實踐

最低要求

  • 具備對生物成像概念的基本理解
  • 熟悉顯微鏡和組織學技術
  • 具備基本的計算機素養

目標受眾

  • 從事生物技術和環境毒理學的研究人員
  • 處理組織學和細胞成像的實驗室技術員
  • 對定量形象分析感興趣的科學工作者
 14 小時

課程分類