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課程簡介
Fiji 與 ImageJ 簡介
- Fiji 概觀及其在科學研究中的應用
- 理解 ImageJ 的架構和插件
- 安裝和設置 Fiji 以實現最佳性能
基礎形象處理技術
- 形象採集與導入格式
- 調整對比度、亮度及應用濾鏡
- 形象堆疊和投影方法
進階形象分析
- 分割技術:閾值化和邊緣檢測
- 組織學樣本中的目標計數和粒子分析
- 測量面積、周長及其他形態學特徵
生物樣本的處理
- 處理組織學組織、血紅細胞和藻類的形象
- 顏色去卷积和染色組織的分析
- 時間序列分析和追蹤細胞運動
自動化與自定義
- 創建和運行宏以處理重複任務
- 使用 Fiji 插件進行專業化分析
- 使用 ImageJ 宏語言 (IJM) 進行基礎腳本編程
數據管理與報告
- 導出結果並生成報告
- 標註形象並準備用於發表的數據
- 可重複形象分析的最佳實踐
最低要求
- 具備對生物成像概念的基本理解
- 熟悉顯微鏡和組織學技術
- 具備基本的計算機素養
目標受眾
- 從事生物技術和環境毒理學的研究人員
- 處理組織學和細胞成像的實驗室技術員
- 對定量形象分析感興趣的科學工作者
14 小時